Chaque année, les IPSO désignent leur Conseil d’administration, qui est composé d’au plus 13 personnes. L’organisation est actuellement présidée par Pierre Serré.

Les IPSO comptent aussi dans leurs rangs trois membres honoraires, désignés en raison de leur contribution exceptionnelle à l’organisation et à la promotion de l’indépendance nationale :

• Mme Ercilia Palacio-Quintin, professeure émérite de l’UQTR

• M. Gilbert Paquette, professeur émérite de l’Université TÉLUQ

• M. Guy Rocher, professeur émérite de l’Université de Montréal